Pesquisadores avaliam abordagens de espectrometria de massa para identificação de fungos

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Jun 10, 2023

Pesquisadores avaliam abordagens de espectrometria de massa para identificação de fungos

16 de janeiro de 2023 Este

16 de janeiro de 2023

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pela Universidade Chung Ang

Nos últimos anos, fungos ou bolores filamentosos surgiram como agentes causadores subjacentes a infecções com risco de vida em indivíduos imunocomprometidos. O manejo oportuno dessas infecções requer o diagnóstico rápido e preciso do mofo em ambientes clínicos.

Infelizmente, os métodos tradicionais são demorados, devido aos longos períodos de incubação necessários para cultivar e examinar os fungos. Por outro lado, técnicas moleculares avançadas são mais sensíveis e eficientes.

Uma dessas técnicas que pode detectar isolados de fungos filamentosos com alta sensibilidade e reprodutibilidade é a espectrometria de massa por dessorção a laser assistida por matriz com tempo de voo (MALDI-TOF MS). Ele pode diferenciar as amostras com base nas variações de massa e carga. No entanto, não é amplamente utilizado devido a limitações na disponibilidade de banco de dados e falta de procedimentos padronizados.

Recentemente, uma equipe de pesquisadores da Chung-Ang University, República da Coreia, liderada pelo professor Mi-Kyung Lee, avaliou três diferentes abordagens MALDI-TOF MS usadas em ambientes clínicos domésticos, para a identificação de fungos.

Em seu estudo publicado no The Journal of Clinical Microbiology em 26 de outubro de 2022, eles compararam o desempenho e a precisão diagnóstica do Bruker Biotyper, ASTA MicroIDSys e Vitek MS. Eles também avaliaram a sensibilidade de três métodos de pré-tratamento - "direto", "na placa" e "no tubo" - usando 84 isolados de fungos filamentosos.

Explicando a lógica por trás de seu estudo, o Prof. Lee diz: "A seleção de um método de preparação de amostra adequado pode melhorar a eficiência e a precisão da identificação do molde. Além disso, o desenvolvimento de processos sistematizados no nível de diagnóstico pode contribuir para tratamentos eficazes para pacientes".

O estudo constatou que o Bruker Biotyper identificou 71,43% dos isolados corretamente até o nível de espécie ou gênero, enquanto o ASTA MicroIDSys e o Vitek MS demonstraram taxas de precisão de 70,24% e 55,95%, respectivamente. Além disso, o método direto de preparação de amostras foi favorável em relação aos outros dois métodos, devido à sua simplicidade e facilidade de aplicação. Notavelmente, a sensibilidade de identificação não diferiu significativamente entre os diferentes métodos de preparação de amostras.

A taxa de identificação incorreta é uma consideração importante em laboratórios clínicos porque pode levar a intervenções de tratamento inadequadas para os pacientes. Neste estudo, apenas um isolado foi identificado erroneamente usando o Vitek-MS com o método on-plate. Além disso, a identificação em nível de espécie de Aspergillus (um microrganismo altamente prevalente e clinicamente significativo) foi maior por meio do Vitek-MS, indicando a aplicabilidade dessa técnica em ambientes clínicos.

O número de espécies identificadas incorretamente foram 17, 15 e 23 através do Bruker Biotyper, ASTA MicroIDSys e Vitek MS, respectivamente. A equipe sugeriu a necessidade de avaliações adicionais se a identificação incorreta ocorresse devido à ausência de certas espécies na biblioteca, e não a um erro. Além disso, a equipe determinou que quaisquer diferenças na sensibilidade poderiam ser atribuídas a diferenças nos bancos de dados do sistema.

Em resumo, MALDI-TOF MS é uma técnica valiosa que pode identificar com precisão microrganismos clinicamente significativos em tempo hábil. A padronização do processo e as diretrizes que podem ser aplicadas a uma ampla gama de espécies podem ajudar a reduzir o viés do processo que ocorre por meio dessas técnicas. Além disso, as limitações relacionadas aos parâmetros de aquisição, qualidade da matriz e hardware requerem avaliações adicionais.